При необходимости подписать документ в системе, пользователю сообщается (выводится на экран) 6-значное кодовое число документа, которое необходимо ввести в мобильный телефон. В ответ приложение MobiPass вычисляет 6-разрядное значение одноразового ключа, необходимого для подтверждения проведения операции. В целях защиты от несанкционированного использования приложения MobiPass требует ввода персонального 4-значного PIN-кода при генерации каждого одноразового ключа.

Если произошла ошибка и клиент ввел неверный ключ, то у него есть ещё несколько попыток на ввод одноразового пароля, после чего использование клиентом приложениеMobiPass будет заблокировано.